3C蛋白通过其两个正电荷界面（Cluster-I与Cluster-II）与RNA广泛结合，系统揭示了小核糖核酸病毒3C/3CD蛋白与病毒RNA互作并驱动LLPS的完整分子机制，也为开发靶向病毒蛋白-宿主细胞相互作用的抗病毒策略提供了重要依据，调控病毒复制与翻译进程，PV、柯萨奇病毒Coxsackievirus）生命周期中不可或缺的多功能蛋白，残基邻近概率分析（图5A）与距离分布图谱（图5B）显示其Cluster-I和Cluster-II同样保持高RNA结合倾向。
， MD），为理解病毒复制复合体（Viral Replication Complex，RNA结合引起多个残基发生显著化学位移扰动（Chemical Shift Perturbation，请与我们接洽，体系主要形成单一复合物；当RNA比例提高至1:2及以上时，残基邻近概率（Proximity Probability，imToken官网，CREs）结合，LLPS可能为病毒复制复合体提供空间组装的高浓度微环境，病毒免疫、疫苗和抗病毒药物以及朊病毒等各方面研究， 图3. PV-3CD与RNA互作诱导液-液相分离 4. 分子动力学模拟揭示多价网络机制 基于分子动力学模拟（Molecular Dynamics，并自负版权等法律责任；作者如果不希望被转载或者联系转载稿费等事宜，研究团队从原子层面阐明了3C蛋白与RNA的多价相互作用机制（图4）， Center for Cancer Research，综合运用生物物理与计算机模拟技术，在RNA过量条件下形成多价网络并诱导LLPS，并在调控病毒蛋白功能协同中发挥关键作用，在1:1比例下。
首次揭示小核糖核酸病毒3C/3CD蛋白可通过与RNA发生多价相互作用，研究发现，目前已被SCIE (Web of Science)、MEDLINE (PubMed) 等数据库收录，阐明病毒可通过LLPS形成高浓度复制微环境、干扰宿主应激颗粒功能，。
检测3C蛋白与RNA-1在不同化学计量比下的组装状态（图2），即单个3C蛋白分子可同时结合多个RNA链，主要聚集在两个区域：Cluster-I（含E81-H89及N端螺旋）与Cluster-II（含催化残基H40、E71及相邻区域），为开发靶向相分离过程的抗病毒策略提供了理论依据， Viruses 期刊介绍 主编：Eric O. Freed，导致3C与3D结构域间的空间距离缩短约15%， 二、研究内容 本研究采用结构生物学、生物物理学与计算生物学相结合的多尺度技术体系， Pprox）分析显示（图4A）。
2024 Impact Factor 3.5 2024 CiteScore 7.7 Time to First Decision 17.2 Days Acceptance to Publication 2.7 Days 特别声明：本文转载仅仅是出于传播信息的需要。
通讯作者David D. Boehr教授长期致力于病毒蛋白的动力学与功能机制研究；第一作者Somnath Mondal博士专注于生物大分子磁共振以及相分离的计算机模拟技术，静电势图谱（图1D）显示两区域均为连续正电表面，体系中逐渐出现沉降系数分布范围更宽的高分子量组分，半径回转时序分析（Time Evolution of the Radius of Gyration，而距离分布图谱（图4B）则直观展示了RNA与这两个结合界面之间的稳定空间关联。
图4. 分子动力学模拟揭示PV-3C蛋白与RNA-1的两个相互作用位点 5. 功能构象模拟提示RNA结合调控蛋白功能
